按照化粪池的技术标准，化粪池的污泥清掏时间一般为90天、180天、360天，被清掏的污泥可以作为有机肥料，或者进行无害化处置。但是，随着化肥的广泛使用，社会的发展，使用粪便肥料越来越少，与此同时，我国污泥处置行业严重滞后，粪便污泥的无害化处理不足，我国13.6亿人每年产生超亿吨的粪便污泥，根据数据，2012年无害化处理的粪便污泥只有801.4万吨。大量粪便污泥的清掏转移，造成了二次污染。因此，如果不能解决化粪池污泥的无害化处置问题，化粪池污泥就会成为水污染的污染源，化粪池问题是关系水污染治理成效的环保问题。

化粪池清理程序：钩打开化粪池的盖板敞开15分钟，把吸粪车开到工作现场，套好吸粪管放入化粪池内，再用铁铲搅动化粪池内粪便结块层，一边放水一边搅动，启动吸粪车开关，吸出粪便直至化粪池内的结块物吸完为止，盖回化粪池盖板，用清水冲洗净工作现场。

化粪池清理注意事项：池内的沼气的毒易燃易爆，故应待充分散发后才能作业，且周围不得有明火。吸粪作业时防止弄脏工作现场和过往人的衣服。揭开盖子后要有专人看护，清理后盖实以防行人跌入。提供化粪池清理服务。

三格式化粪池是由三个相互连通的密封粪池组成，粪便由进粪管进入池依此顺流至第三池，其各池的主要原理：

池：主要截留含虫卵较多的粪便，粪便经发酵分解，松散的粪块因发酵膨胀而浮升，比重大的下沉，因而形成上浮的粪皮、中层的粪液和下沉的粪渣。利用的比重大于粪尿混合液的原理使其自然沉降于化粪池底部。利用粪液的浸泡和翻动化解粪块使其液化并截留粪渣于池底。厌氧发酵：化粪池的密闭厌氧环境，可以分解蛋白性有机物，并产生氨等物质，这些物质具有杀灭卵及病菌的作用。

第二池：起进一步发酵、沉淀作用，与池相比，第二池的粪皮和粪渣的数量减少，因此发酵分解的程度较低，由于没有新粪便的进入，粪液处于比较静止状态，这有利于漂浮在粪池中的虫卵继续下沉。

第三池：主要起储存粪液的作用。经前二格处理的粪液进入第三池，基本上已经不含卵和病原微生物，达到了粪便无害化要求，可以供农田直接施肥。